Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf170A2RU37 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms