Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms