Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 LINC02162-201ENST00000512521 574 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC246817.2-201ENST00000523971 577 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AL136088.1-201ENST00000531002 541 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 CCDC60-204ENST00000539847 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC122688.2-201ENST00000543922 585 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC027020.1-201ENST00000559349 632 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RPLP1-205ENST00000560274 256 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 GS1-279B7.1-201ENST00000562817 399 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 OR7A18P-201ENST00000600416 277 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AL109933.4-201ENST00000612111 157 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 MILR1-202ENST00000612535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 FLII-230ENST00000628188 156 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AP000356.4-201ENST00000639500 172 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 OR9K2-204ENST00000641374 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 SLC39A12-204ENST00000539911 2461 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 NBPF15-206ENST00000581897 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 ALDH1A1-201ENST00000297785 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 TRIM51HP-202ENST00000530412 1823 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 KIAA1257-205ENST00000515659 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 PROM1-210ENST00000510224 4006 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 ZNF713-206ENST00000633730 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RHOJ-201ENST00000316754 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 PIK3C3-204ENST00000586545 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 SLC35A3-201ENST00000370153 5708 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 TMCO5A-201ENST00000319669 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 OR10J3-201ENST00000332217 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 DPM1-201ENST00000371582 1161 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 LST1-211ENST00000376110 433 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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SCN2BO60939 AL139806.1-201ENST00000403057 1002 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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SCN2BO60939 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 CNPY1-204ENST00000636446 1637 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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SCN2BO60939 IRAK4-202ENST00000440781 1409 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 ZNF812P-202ENST00000536819 1890 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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SCN2BO60939 LINC00299-201ENST00000430192 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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SCN2BO60939 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 OR1L8-202ENST00000641027 2024 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 GRIA4-206ENST00000525187 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 CDC42-201ENST00000315554 1452 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 FLJ42393-201ENST00000623801 2270 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 FKTN-202ENST00000357998 2404 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 TSSK4-201ENST00000287913 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 IL37-203ENST00000349806 589 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 Metazoa_SRP.2-201ENST00000359385 269 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RNA5SP389-201ENST00000362610 115 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RNA5SP226-201ENST00000362653 115 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RNA5SP161-201ENST00000363871 115 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RNA5SP149-201ENST00000364952 92 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RNU1-122P-201ENST00000365538 156 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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