Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 THAP12P7-201ENST00000520248 2290 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 RECQL-204ENST00000444129 3702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 LINC02159-202ENST00000518580 2323 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 PIGN-225ENST00000638435 4382 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 ENTPD5-201ENST00000334696 5842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 AC106882.1-201ENST00000515789 2371 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 AC008676.2-202ENST00000509655 1992 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 AC093909.4-201ENST00000514297 1991 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 OTX2-201ENST00000339475 3001 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 FKTN-202ENST00000357998 2404 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 LINC00506-203ENST00000629295 4300 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 PPHLN1-202ENST00000317560 1359 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 LIPF-202ENST00000355843 1357 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 SORL1-212ENST00000534286 3501 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 ARMC3-203ENST00000409049 2479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 EEF1A1P4-201ENST00000359165 1405 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 VPS41-202ENST00000310301 5903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 KIF15-201ENST00000326047 4842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 RSPH4A-201ENST00000229554 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 LIN9-205ENST00000481685 1916 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 ALB-203ENST00000415165 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
STRADAQ7RTN6 FTO-222ENST00000637969 2889 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 ANKS1B-201ENST00000329257 996 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 CREM-214ENST00000395887 849 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 U3.31-201ENST00000408113 216 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 PCBP1-AS1-212ENST00000418308 863 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 AC006013.1-201ENST00000424888 758 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 DDX11L10-201ENST00000430178 571 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 BX322234.2-202ENST00000435612 479 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 AC074286.1-202ENST00000441205 567 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 TDGF1P6-201ENST00000463873 448 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 RPL12P40-201ENST00000467028 488 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 CREM-224ENST00000468236 582 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 RN7SL414P-201ENST00000469545 294 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 CREM-234ENST00000484283 660 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 ZSWIM7-209ENST00000486655 726 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 CREM-236ENST00000487763 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 RN7SL635P-201ENST00000492123 296 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 C1orf112-208ENST00000496973 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 AC021491.1-201ENST00000502300 349 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 AC023886.1-201ENST00000506057 685 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 LINC01606-205ENST00000519314 562 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 IGLV10-67-201ENST00000519446 325 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 LINC00958-202ENST00000526388 607 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 AC099508.2-201ENST00000563098 510 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 AC090415.1-201ENST00000581877 847 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 AC005884.1-201ENST00000588604 429 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 AC005518.2-201ENST00000603254 282 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 TATDN1-220ENST00000605953 726 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 AL669830.1-201ENST00000621457 656 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 KCNK2-203ENST00000444842 3379 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 AMZ2-210ENST00000580753 1339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 SORBS1-208ENST00000371241 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 ZNF192P2-201ENST00000402215 1383 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 CAP1-206ENST00000372805 2217 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 CD40LG-201ENST00000370628 1720 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 AC016747.1-201ENST00000420918 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 C11orf88-203ENST00000529167 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 LRRC2-AS1-201ENST00000599511 2291 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 ZMYM6-203ENST00000373333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 RIPOR2-208ENST00000613507 5539 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 EPB41L2-228ENST00000531410 2926 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 FAM186A-201ENST00000327337 7127 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 NDUFS1-204ENST00000440274 2394 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 RNA5SP79-201ENST00000365193 109 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 RPL34-201ENST00000394665 529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 RPL34-202ENST00000394667 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 RPL5P8-201ENST00000396820 815 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 HSPE1-202ENST00000409468 570 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 RN7SKP89-201ENST00000410774 242 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 LINC02470-201ENST00000412084 979 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 AL590240.2-201ENST00000413370 894 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 LINC00222-203ENST00000416890 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 GNAI2P2-201ENST00000417003 916 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 AC130472.1-201ENST00000427885 309 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 AC245047.5-201ENST00000437312 556 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 AC018738.1-201ENST00000441378 210 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 AC107983.1-201ENST00000442562 210 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
STRADAQ7RTN6 LINC02549-201ENST00000445346 674 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms