Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL022318.4-202ENST00000622217 591 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL662791.5-201ENST00000623334 466 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 Z98043.1-201ENST00000624123 339 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL049541.1-201ENST00000630976 642 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 C2orf83-204ENST00000641422 291 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 GULP1-202ENST00000409580 3544 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 SULT1C2-201ENST00000251481 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 DLG2-202ENST00000330014 2789 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 F11-AS1-202ENST00000508110 1512 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ZMAT4-201ENST00000297737 2466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 CACNA1D-201ENST00000288139 9341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 NEK10-201ENST00000295720 2871 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MSL3-201ENST00000312196 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 SOX6-210ENST00000528252 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 PDIK1L-201ENST00000374269 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 FLJ21408-201ENST00000499939 2594 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 PIGN-221ENST00000638183 4046 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MEMO1-203ENST00000404530 1482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 BMS1P1-201ENST00000374336 1332 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL133467.3-203ENST00000461160 3574 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC097662.1-204ENST00000396588 2214 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 CAST-204ENST00000341926 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ZFP42-202ENST00000509524 2480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 OR2T11-202ENST00000641193 3770 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC110998.1-201ENST00000519029 2053 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 NOTCH2-206ENST00000579475 2954 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 C14orf2-203ENST00000553430 1659 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 GCNT2-202ENST00000316170 4381 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 OR5E1P-201ENST00000305754 927 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AIF1-203ENST00000376059 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 SNORA14B-201ENST00000384452 135 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 TRBV5-1-201ENST00000390381 652 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC243547.1-201ENST00000415065 408 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 CHL1-AS1-201ENST00000417612 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 PIGX-204ENST00000421265 677 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL671986.1-201ENST00000422197 955 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC110995.1-202ENST00000422914 860 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 KDM4A-AS1-203ENST00000434346 833 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AP000474.1-201ENST00000441465 680 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL772284.1-201ENST00000443421 905 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 LINC02022-201ENST00000448129 635 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 OR5S1P-201ENST00000453063 951 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 GGTA1P-204ENST00000488429 1104 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RN7SL130P-201ENST00000489463 305 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RPL34P29-201ENST00000491411 325 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 BX293995.1-201ENST00000502880 755 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC103770.1-201ENST00000517884 833 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 IGLVI-68-201ENST00000519525 345 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MED30-204ENST00000522839 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC023644.1-201ENST00000523380 859 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 OR4A1P-201ENST00000532342 920 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RASSF8-AS1-204ENST00000535436 1121 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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PDCD1Q15116 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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PDCD1Q15116 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ELOF1-207ENST00000591674 679 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC020908.2-201ENST00000595134 405 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL049829.3-202ENST00000604278 711 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC018926.2-201ENST00000611214 498 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC079779.3-218ENST00000612487 940 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC091953.4-201ENST00000625179 341 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 PGAM1P5-203ENST00000626376 313 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC068631.1-215ENST00000630331 490 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 BTN2A1-201ENST00000312541 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 UTP23-201ENST00000309822 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 APBB2-224ENST00000513140 4166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 TP63-201ENST00000264731 4909 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 PLEKHS1-203ENST00000369309 2534 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 SCAND2P-201ENST00000348993 8975 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ALG13-201ENST00000251943 3997 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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