Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 FANK1-AS1-201ENST00000445458 428 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 DNAJC9-AS1-203ENST00000457758 548 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 ATP1B3-202ENST00000462082 837 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 RPL12P5-201ENST00000475149 392 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 APOPT1-206ENST00000476323 757 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 AC084871.2-201ENST00000503355 464 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 AC233724.1-201ENST00000503894 233 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 GSTO3P-201ENST00000504733 718 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 AC108073.1-201ENST00000508231 674 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 PIGFP1-201ENST00000519180 653 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 OPRK1-204ENST00000524278 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 CRADD-211ENST00000552983 839 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 RPL27-205ENST00000589037 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 AC006130.1-201ENST00000589365 555 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 AC008737.3-201ENST00000601661 221 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 U1.22-201ENST00000605806 164 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 SLC20A1P2-201ENST00000618036 966 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 AL356289.1-201ENST00000635446 743 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 AC108477.1-201ENST00000636764 526 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 ALG8-221ENST00000615266 1469 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 AC026398.1-201ENST00000413683 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 AL445231.1-201ENST00000445523 1814 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 AC068512.1-201ENST00000584542 1811 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 2191 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 MS4A7-202ENST00000358246 2871 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 PIWIL2-205ENST00000611073 2864 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 EML5-201ENST00000380664 5910 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 TMSB15B-208ENST00000620307 2286 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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PDK4Q16654 MFSD8-218ENST00000641186 4448 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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PDK4Q16654 CHD6-201ENST00000309279 1635 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 CAST-228ENST00000509903 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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PDK4Q16654 MRPL55-211ENST00000366738 705 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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PDK4Q16654 ZNF493-205ENST00000596302 546 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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PDK4Q16654 GLRA3-202ENST00000340217 3065 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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PDK4Q16654 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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PDK4Q16654 ANKRD55-202ENST00000434982 1518 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 KLRC1-207ENST00000544822 1600 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 DTNA-209ENST00000556414 1626 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 BEST3-205ENST00000488961 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 MORF4L2-210ENST00000451301 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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PDK4Q16654 MS4A2-201ENST00000278888 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 PID1-201ENST00000354069 839 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 AC093392.1-201ENST00000366280 340 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 U3.34-201ENST00000408198 212 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 AC008063.1-201ENST00000418335 640 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 TRIM43CP-201ENST00000422468 1028 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 GH2-202ENST00000423893 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 AC098828.1-201ENST00000436164 440 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 SMYD1-202ENST00000438570 680 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 TXNP3-201ENST00000454560 301 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PDK4Q16654 AC096915.1-201ENST00000456185 512 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
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