Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms