Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDY1Q9Y6F8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms