Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms