Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP16Q9Y5T5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms