Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms