Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms