Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP3Q9Y446 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms