Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP1Q9Y3L3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms