Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND2Q9UQB3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms