Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP1Q9UPQ3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms