Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms