Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDRG4Q9ULP0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms