Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED23Q9ULK4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms