Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms