Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SALL4Q9UJQ4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms