Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPA4Q9UI42 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms