Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO40Q9UH90 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms