Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCF2Q9UG63 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms