Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
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COPS7AQ9UBW8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPS7AQ9UBW8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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COPS7AQ9UBW8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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COPS7AQ9UBW8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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COPS7AQ9UBW8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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