Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLKQ9UBT6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms