Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP28Q9P2N2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms