Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP4Q9P0V3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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