Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms