Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGA3Q9NZ52 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms