Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMOD3Q9NYL9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
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