Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms