Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms