Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms