Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms