Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms