Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TM7SF3Q9NS93 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms