Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TULP4Q9NRJ4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms