Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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LHX9Q9NQ69 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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LHX9Q9NQ69 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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LHX9Q9NQ69 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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LHX9Q9NQ69 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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