Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP3Q9H6T3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms