Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1DQ9H5J8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms