Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E7

DEF6, Differentially expressed in FDCP 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEF6Q9H4E7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEF6Q9H4E7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEF6Q9H4E7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms