Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms