Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIPK3Q9H422 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms