Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms