Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms