Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NYXQ9GZU5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NYXQ9GZU5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms