Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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