Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms