Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM6Q9C030 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM6Q9C030 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM6Q9C030 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM6Q9C030 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM6Q9C030 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM6Q9C030 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM6Q9C030 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM6Q9C030 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM6Q9C030 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM6Q9C030 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM6Q9C030 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM6Q9C030 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM6Q9C030 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM6Q9C030 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM6Q9C030 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM6Q9C030 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM6Q9C030 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM6Q9C030 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms